伝令RNA   分子生物学 において、伝令RNA (でんれいアールエヌエー、英 : messenger ribonucleic acid )は、mRNA またはメッセンジャーリボ核酸 とも呼ばれ、タンパク質 を合成 する過程でリボソーム によって読み取られる、遺伝子 の遺伝子配列 に対応する一本鎖のリボ核酸 (RNA)分子 である。  
mRNAは、RNAポリメラーゼ という酵素 が遺伝子を一次転写産物 のmRNA前駆体 (pre-mRNA)に変換する転写 過程で作られる。このpre-mRNAには通常、最終的なアミノ酸配列 をコード しないイントロン という領域が含まれるが、これらはRNAスプライシング の過程で除去され、タンパク質をコードする領域であるエクソン のみが残る。このエクソン配列が成熟mRNA を構成する。  次に、リボゾームが成熟mRNAを読み取り、転移RNA (tRNA)が運ぶアミノ酸 を利用してタンパク質を作り出す。この過程は翻訳 として知られている。  これらの過程はすべて、生物系 (英語版 ) セントラルドグマ の一部を形成する。  
mRNAの遺伝情報は、デオキシリボ核酸 (DNA)と同様にヌクレオチド 配列に含まれ、おのおのが3連のリボヌクレオチド からなるコドン に配列されている。各コドンは、特定のアミノ酸 をコードしているが、タンパク質合成を停止させる終止コドン は例外である。コドンからアミノ酸へ翻訳するためには、コドンを認識して対応するアミノ酸を供給する転移RNAと、リボソームに含まれるタンパク質製造装置の中心的な構成要素であるリボソームRNA (rRNA)の2種類のRNAが必要である。  
mRNAの概念は、1960年にシドニー・ブレナー とフランシス・クリック によって発展した(歴史 を参照)。実験検証を行う過程で、フランソワ・ジャコブ とジャック・モノー が「メッセンジャーRNA(messenger RNA )」という名称を作り出した。1961年、ジェームズ・ワトソン の研究チームと、ジャコブ、モノー、マシュー・メセルソン のチームによって、mRNAが単離され、独立して記述された。  
  
  mRNA分子は転写から始まり、最終的に分解されて短い生涯を終える。mRNA分子はその寿命の間、翻訳前にプロセシング 、編集、そして輸送されることもある。真核生物のmRNA分子は、しばしば広範なプロセシングや輸送を必要とするが、原核生物 のmRNA分子はそうではない。真核生物 のmRNA分子とそれに結合したタンパク質を合わせてメッセンジャーRNP (英語版 ) 
  転写 DNAからRNAをコピーすることを転写 という。転写の際、RNAポリメラーゼ は必要に応じてDNAからmRNAへの遺伝子コピーを作成する。この過程は真核生物と原核生物でわずかに相違する。顕著な相違の一つは、原核生物のRNAポリメラーゼは転写中にDNA処理酵素と結合し、転写中にプロセシングを進めることができる。それによって、新しいmRNA鎖はtRNA鎖と呼ばれる相補鎖 を生成して二本鎖となり、両者が結合すると塩基対 形成による構造形成ができなくなる。さらに、mRNAの鋳型はtRNAの相補鎖であり、DNAが結合するアンチコドン 配列と同じ配列である。短命で、未プロセシングあるいは部分的にプロセシングされた転写産物を前駆体mRNA、またはpre-mRNA 成熟mRNA 
  真核生物のpre-mRNAプロセシング (上段) DNA遺伝子はpre-mRNAに転写される。(中段) その後、pre-mRNAはプロセシングを経て成熟mRNAを形成する。(下段) 最終的に成熟mRNAはリボソームによって翻訳されてタンパク質が生成する。 mRNAのプロセシングは、真核生物 、細菌 、および古細菌 の間で大きく異なっている。非真核生物のmRNAは、本質的に転写された時点で成熟しており、まれな場合を除いてプロセシングを必要としない[1] 
  スプライシング RNAスプライシング は、真核生物のpre-mRNAが成熟mRNAに至る広範なプロセシングであり、イントロン やアウトロン (非コード領域)が除去され、エクソン (コード領域)が結合する機構である。  
  5'キャップの付加 5'キャップ 5' cap、 RNAキャップ、RNA 7-メチルグアノシン キャップ、RNA m7 Gキャップとも呼ばれる)とは、真核生物のメッセンジャーRNAの転写開始直後にその先端部つまり5'末端 に付加された修飾グアニン ヌクレオチドである。5'キャップは、末端の7-メチルグアノシン残基からなり、5'-5'-トリリン酸結合を介して最初の転写ヌクレオチドに結びつく。その存在は、リボソーム による認識とリボヌクレアーゼ (RNase)酵素からの保護において重要である。  
キャップの付加は転写と連動しており、相互に影響を与えるように共転写的に行われる。転写開始の直後、合成されるmRNAの5'末端は、RNAポリメラーゼ に結合しているキャップ結合複合体 (英語版 ) 酵素 複合体は、mRNAのキャッピングに必要な化学反応を触媒 する。合成は多段階の生化学 反応として進行する。  
  編集 場合によって、mRNAが編集 されて、そのヌクレオチド組成が変化することがある。ヒトを例にとると、アポリポタンパク質B (英語版 ) 
  ポリアデニル化 ポリアデニル化 (polyadenylation )とは、メッセンジャーRNA分子にポリアデニリル部を共有結合 させることである。真核生物では、ほとんどのメッセンジャーRNA(mRNA)分子が3'末端でポリアデニル化されているが、最近の研究では、ウリジン の短い伸長(オリゴウリジル化)も一般的であることが示されている[2] ポリ(A)テール とそれに結合したタンパク質は、エキソヌクレアーゼ による分解からmRNAを保護することを助ける。また、ポリアデニル化は、転写終結、mRNAの核外輸送 、および翻訳にも重要である。原核生物では、mRNAがポリアデニル化されると、ポリ(A)テールがエキソヌクレアーゼ分解を妨げるのではなく、むしろ促進するように作用することもある。  
ポリアデニル化は、DNAからRNAへ転写される際、および(または)その直後に起こる。転写が終了すると、RNAポリメラーゼに結合するエンドヌクレアーゼ複合体の働きによって、mRNA鎖は切断される。mRNAが切断された後、切断部位の遊離3'末端に約250のアデノシン残基が付加される。この反応は、ポリアデニル酸ポリメラーゼ (英語版 ) 選択的スプライシング と同様に、1つのmRNAに複数種のポリアデニル化変異体が存在する可能性がある。  
また、ポリアデニル化部位の変異も起こる。遺伝子の一次RNA転写産物は、ポリA付加部位で切断され、RNAの3'末端に100-200個のアデノシン残基が付加される。この部位が変化すると、異常に長く、不安定なmRNAコンストラクトが形成される。  
  輸送 真核生物と原核生物のもう一つの違いは、mRNAの輸送に関するものである。真核生物では転写と翻訳は区画的に分割 されているため、真核生物ではmRNAを細胞核 から細胞質 へ輸送しなくてはならない。この過程は、さまざまなシグナル伝達経路 によって制御されている可能性がある[3] キャップ結合タンパク質(CBC) (英語版 ) [4] 転写/核外輸送複合体(TREX) に結合することによって、核膜孔 から輸送される[5] [6] [7] 
空間的に複雑な細胞では、いくつかのmRNAは特定の細胞内目的地に輸送される。成熟した神経細胞 では、ある種のmRNAが神経細胞体 から樹状突起 に輸送される。mRNA翻訳が行われる部位の一例は、シナプスの下に選択的に局在するポリリボソーム である[8] Arc/Arg3.1 のmRNAは、シナプス活動によって誘導され、NMDA受容体 が生成するシグナルに基づいて、活動的なシナプス近傍に選択的に局在される[9] βアクチン (英語版 ) [10] アクチン のmRNAは、細胞核から輸送されるときに、ZBP1 (英語版 ) 40Sサブユニット (英語版 ) モータータンパク質 によって結合され、細胞骨格 に沿って目的位置(神経突起伸長部 )に輸送される。最終的に、ZBP1がSrc (英語版 ) リン酸化 され、翻訳が開始される[11] 軸索 、特に成長円錐 にも輸送される。多くのmRNAには、特定の場所に輸送するために、いわゆる「ジップコード(郵便番号の意)」が付与されている[12] 細胞膜ナノチューブ (トンネルナノチューブ)と呼ばれる構造体を通じて、哺乳動物 細胞間でも移動することができる[13] [14] 
  翻訳 原核生物のmRNAは、プロセシングや輸送を必要としないため、転写終了後すぐにリボソーム により翻訳を開始することができる。したがって、原核生物における翻訳は転写と共役しており、共転写的に行われていると言える。  
真核生物のmRNAは、プロセシングされて細胞質に輸送された後(すなわち成熟mRNA)、リボソームによって翻訳することができる。翻訳は、細胞質内を自由に浮遊しているリボソームで起こる場合と、シグナル認識粒子 によって誘導されて、小胞体 に結合したリボソームで起こる場合がある。したがって、原核生物とは異なり、真核生物における翻訳は転写と直接的に結びついていない。乳癌 (がん)で監視されるEEF1A1 (英語版 ) [15] [要非一次資料  。  
  成熟した真核生物のmRNAの構造。完全にプロセシングされたmRNAは、(左から右へ) 5'キャップ 、5' UTR 、コーディング領域 、3' UTR 、およびポリ(A)テール から構成される。 コーディング領域 コーディング領域 (coding regions )はコドン (遺伝暗号ともいう)で構成され、リボソームによって解読され、さらにタンパク質へ翻訳される。これは、真核生物では通常1つなのに対し、原核生物では通常複数である。コーディング領域は、開始コドン で始まり、終止コドン で終わる。一般に、開始コドンはAUGトリプレットで、終止コドンはUAG(アンバー)、UAA(オーカー)、またはUGA(オパール)である。コーディング領域は内部の塩基対によって安定化する傾向があり、これが分解を妨げている[16] [17] コードする ことに加え、その一部はエクソン性スプライシングエンハンサー (英語版 ) エクソン性スプライシングサイレンサー (英語版 ) pre-mRNA 中の制御配列 (英語版 ) 
  非翻訳領域 非翻訳領域 (untranslated regions 、UTR)は、mRNAのうち、開始コドンの前および停止コドンの後で翻訳されない領域のことで、それぞれ5' 非翻訳領域 (5' UTR)と3' 非翻訳領域 (3' UTR)と呼ばれる。これらの領域はコーディング領域と一緒に転写されるため、成熟mRNA中にそのまま存在することからエクソン性 (exonic )という。遺伝子発現 に関わる非翻訳領域のいくつかの役割は、mRNAの安定性、mRNAの局在化、翻訳効率 (英語版 ) [18] 
mRNAの安定性は、リボヌクレアーゼ というRNA分解酵素や、RNA分解を促進または阻害する補助タンパク質に対する親和性が異なるため、5' UTRおよび(または)3' UTRによって制御されている可能性がある (Cリッチ安定化配列 (英語版 ) 
翻訳効率は、時には翻訳を完全に阻害することも含め、UTRによって制御することができる。3' UTRまたは5' UTRに結合するタンパク質は、リボソームがmRNAに結合する能力に働きかけることで、翻訳に影響を及ぼす可能性がある。また、3' UTRに結合したマイクロRNA (miRNA)も、翻訳効率やmRNAの安定性に影響を及ぼす可能性がある。  
mRNAの細胞質局在性は、3' UTRの機能であると考えられている。細胞内の特定の領域で必要とされるタンパク質は、その場所で翻訳されることもある。このような場合、3' UTRには、転写産物を翻訳するためにこの領域に局在化させる配列が含まれている可能性がある。  
非翻訳領域に含まれる配列の中には、RNAに転写されると特徴的な二次構造 を形成するものがある。これらの構造的なmRNA配列は、mRNAの調節に関与している。SECIS配列 (英語版 ) リボスイッチ は、小分子 と直接結合してその折りたたみを変化させて転写や翻訳のレベルを変更する。こうした場合、mRNAはそれ自身を制御している。  
  3'ポリ(A)テール(3' poly(A) tail )は、pre-mRNAの3'末端に付加されたアデニン ヌクレオチドの長い配列である(配列長は数100個が多い)。このテール(尾部)は、細胞核からの輸送と翻訳を促進するとともに、mRNAを分解から保護する役割を持つ。  
  モノシストロン型とポリシストロン型の違い mRNA分子が、単一のタンパク質鎖 (ポリペプチド)のみを翻訳 するための遺伝情報を含む場合、モノシストロン型(monocistronic mRNA )であるという。ほとんどの真核生物 のmRNAはこのようなケースである[19] [20] polycistronic mRNA )mRNAは、複数のオープン・リーディング・フレーム (ORF)を持ち、それぞれがポリペプチドに翻訳される。これらのポリペプチドは通常、関連する機能を持ち(多くは最終的な複合タンパク質を構成するサブユニット)、それらのコード配列(coding sequence 、CDS)はプロモーター とオペレーター を含む制御領域にまとめられて全体として制御される。細菌 や古細菌 に見られるmRNAのほとんどはポリシストロン型で、ヒトのミトコンドリア ・ゲノム も同様である[19] dicistronic )またはバイシストロン型(bicistronic )のmRNAは、2つのタンパク質 のみをコードしている[21] 
  mRNAの環状化 真核生物では、eIF4E とポリ(A)結合タンパク質 (PABP)が相互作用し、両者が足場タンパク質のeIF4G (英語版 ) [22] 7 Gキャップやポリ(A)テールの欠失を特徴とする)[23] 
この他に、特にウイルスmRNAで、環状化の機構が知られている。ポリオウイルス のmRNAは、その5'末端方向のクローバーリーフ部分を利用してヒトタンパク質PCBP2 (英語版 ) オオムギ黄化萎縮ウイルス (英語版 ) キッシングステムループ (英語版 ) 
RNAウイルスゲノム(その+鎖がmRNAとして翻訳される)も一般に環状化している[要出典  。ゲノム複製の際、環状化はゲノム複製速度を高めるように作用し、リボソームが循環している仮説とほぼ同様に、ウイルスRNA依存性RNAポリメラーゼ を循環させる。  
  同じ細胞内でも、mRNAの寿命(安定性)はそれぞれ異なる。細菌 細胞では、個々のmRNAは数秒から1時間以上生存することができる。しかしその寿命は平均して1-3分であり、細菌のmRNAは真核生物のmRNAよりもはるかに安定性が低い[24] [25] 
  原核生物のmRNA分解 一般的に、原核生物では、真核生物よりもmRNAの寿命がはるかに短い。原核生物は、エンドヌクレアーゼ 、3'エキソヌクレアーゼ 、および5'エキソヌクレアーゼを含むリボヌクレアーゼの組み合わせて、メッセージ(mRNAの意)を分解する。また、数十から数百ヌクレオチド長の小型RNA (英語版 ) RNase III (英語版 ) [26] 
  真核生物のmRNAターンオーバー 真核細胞内では、翻訳 とmRNA分解のプロセス間で釣り合いが保たれている 。活発に翻訳されているメッセージは、リボソーム 、真核生物翻訳開始因子 eIF4E およびeIF4G (英語版 ) ポリ(A)結合タンパク質 によって結合されている。eIF4EとeIF4Gはデキャッピング酵素(DCP2 (英語版 ) エキソソーム複合体 を阻害して、メッセージの末端を保護する。翻訳と分解の釣り合いは、Pボディ (英語版 ) P-bodies )という細胞質構造の大きさと存在量に反映される[27] ポリ(A)テール は、RNA上のシス制御配列とトランス作用性RNA結合タンパク質の組み合わせによって、特定のメッセンジャーRNAを標的とする特殊なエキソヌクレアーゼによって短縮される。ポリ(A)テールの除去は、メッセージの環状構造を破壊し、キャップ結合複合体 (英語版 ) デキャッピング複合体 (英語版 ) 
  AUリッチエレメント分解 一部の哺乳類では、mRNA中にAUリッチエレメント (英語版 ) ポリ(A)テール の除去を促す細胞タンパク質の作用によって、これらの転写産物を不安定化する傾向がある。ポリ(A)テールの欠失は、エキソソーム複合体 [28] デキャッピング複合体 (英語版 ) [29] 腫瘍壊死因子 (TNF)や顆粒球マクロファージコロニー刺激因子 (GM-CSF)のような強力なサイトカイン の過剰産生を防ぐための重要な機構である[30] c-Jun (英語版 ) c-Fos などの発がん性転写因子の生合成も調節する[31] 
  ナンセンス変異依存mRNA分解機構 真核生物のメッセージは、メッセージ中の中途での終止コドン(ナンセンスコドン )の存在をチェックするナンセンス変異依存mRNA分解機構 (NMD)による監視を受けている。ナンセンスコドンは、不完全なスプライシング、適応免疫系 におけるV(D)J遺伝子再構成 、DNAの変異 、転写エラー、フレームシフト (英語版 ) 漏出スキャン (英語版 ) ポリ(A) テール除去、またはヌクレオチド鎖切断 による分解を引き起こす[32] 
  低分子干渉RNA (siRNA) 後生動物 では、酵素であるDicer によって処理された低分子干渉RNA (siRNA)は、RNA誘導サイレンシング複合体 またはRISC(RNA-induced silencing complex)として知られる複合体に取り込まれる。この複合はエンドヌクレアーゼ を含んでおり、siRNAが結合する完全に相補的なメッセージを切断する。その結果として生じたmRNA断片は、エキソヌクレアーゼ によって破壊される。siRNAは、細胞培養において遺伝子の機能を阻害するために、実験室で一般的に使用されている。これは二本鎖RNAウイルス に対する防御としての自然免疫系 の一部であると考えられている[33] 
  マイクロRNA (miRNA) マイクロRNA (miRNA)は、通常、後生動物のメッセンジャーRNAと部分相補的な配列を持つ小型RNAである[34] [35] [36] [37] 
  その他の分解機構 メッセージが分解される機構は他にも、ノンストップ分解 (英語版 ) non-stop decay 、NSD)や、Piwi結合RNA (英語版 ) Piwi-interacting RNA 、piRNA)によるサイレンシング など、さまざまなものがある。  
  ヌクレオシド修飾メッセンジャーRNA (modRNA)配列を投与することで、細胞にタンパク質を作らせることができ、直接的にはそのタンパク質が病気を治療したり、ワクチン として機能する可能性がある。より間接的には、このタンパク質が内在性 幹細胞 を望ましい方法で分化させる可能性がある[38] [39] 
RNA治療の主な課題は、RNAを適切な細胞に送達することにある[40] 免疫系 がRNAを侵入者として攻撃する可能性があること、細胞膜を通過 しないことといった事実も含まれる[39] リボソーム がある細胞質 で活動するためには、細胞の輸送機構を離れなくてはならない[38] 
これらの課題を克服し、1989年に『広く適用可能なin vitro トランスフェクション技術 が開発された後』[41] 個別化がん (英語版 ) 自己免疫疾患 、代謝性疾患 、および呼吸器炎症性疾患に対する治療法と処置法の両面で研究が続けられている。CRISPR (英語版 ) 遺伝子編集療法 も、目的のCas タンパク質を作るよう細胞を誘導するためにmRNAを使用することで、有益となる可能性がある[42] 
2010年代以降、RNAワクチンやその他のRNA治療薬は「新しいクラスの医薬品」と見なされている[43] COVID-19パンデミック の間に、たとえばファイザー - バイオンテック やモデルナ によるCOVID-19ワクチン が世界中で展開された[44] 
  1950年代初頭から、分子生物学の研究によって、タンパク質合成の際にRNAに関連する分子が存在することが示唆された。たとえば、最も古い報告の1つで、ジャック・モノー と彼のチームは、RNA合成がタンパク質合成に必要であることを示し、特に細菌の大腸菌 で酵素であるβガラクトシダーゼ を産生する時に必要なことを示した[45] アーサー・パーディー (英語版 ) [46] アルフレッド・ハーシー 、ジューン・ディクソン 、マーサ・チェイス は、大腸菌内で合成後すぐに消失する特定のシトシン含有DNA(RNAであることを示す)について報告した[47] [48] 
mRNAのアイディアは、1960年4月15日、ケンブリッジのキングス・カレッジ で、シドニー・ブレナー とフランシス・クリックによって最初に着想され、フランソワ・ジャコブ が、アーサー・パーディー、ジャコブ、そしてモノーが最近行った実験について話しをしているときだった。クリックの励ましを受け、ブレナーとジャコブはすぐにこの新しい仮説の検証に着手し、カリフォルニア工科大学 のマシュー・メセルソン に連絡を取った。1960年の夏、ブレナー、ジャコブ、メセルソンの3人は、カリフォルニア工科大学のメセルソンの研究室で実験を行い、mRNAの存在を証明した。その年の秋に、ジャコブとモノーは「メッセンジャーRNA (messenger RNA )」と命名し、その機能を説明する最初の理論的枠組みを構築した[48] 
1961年2月、ジェームズ・ワトソン は、自身の研究グループが彼らのすぐ後を、ほぼ同じ方向で同様の実験を行っていることを明らかにした。ブレナーと他の人たちは、彼らの研究知見の論文発表を遅らせるというワトソンからの要請に同意した。その結果、1961年5月の『ネイチャー 』誌にブレナーとワトソンの論文が同時に掲載され、同じ月の『ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー (英語版 ) Journal of Molecular Biology )』誌にジャコブとモノーはmRNAの理論的枠組みを発表した[49] [48] 
  関連項目       ウィキメディア・コモンズには、
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